Universitas Muhammadiyah Yogyakarta memiliki banyak fasilitas yang mendukung jalannya proses perkuliahan. Salah satunya terdapat layanan IT yang cukup memadai dan dapat digunakan oleh para mahasiswa, dosen, dan karyawan. Beberapa layanan IT yang tersedia di UMY adalah website yang memudahkan mahasiswa/para orangtua mencari info atau berita tentang UMY. Kedua yakni adanya Wifi SSID Eduroam dengan kecepatan 1,2 GB per second yang dapat digunakan secara gratis oleh civitas akademika UMY, hanya dengan memasukkan email universitas dan password dalam kolom username dan password. Di samping itu terdapat KRS Online yang dapat diakses oleh para mahasiswa untuk melihat jadwal kuliah, IPK, dan sebagainya, KRS Online juga dapat diakses oleh orangtua guna melihat perkembangan akademik anak mereka.
Kampus terpadu ini juga memfasilitasi mahasiswa/ wi UMY MyKlass (UMY Online learning) yang digunakan dosen untuk memberikan materi atau tugas kepada mahasiswa tanpa harus bertatap muka. Terdapat juga Blog UMY yang dapat dimanfaatkan oleh mahasiswa untuk menulis karya ilmiah dan mengembangkan potensi dirinya melalui tulisan-tulisan/ karya yang ia buat. Sistem parkir UMY juga sudah berbasis Radio Frequency Identification (RFID). Mahasiswa hanya perlu menempelkan KTM yang sudah menggunakan RFID system di gerbang keluar. Hal menarik lainnya, setiap mahasiswa yang sudah mengaktifkan email universitas akan langsung mendapat akses gratis menggunakan Office 365 dan juga Windows Education. Hebatnya lagi, UMY memiliki server data cadangan yang terletak di Batam, jadi ketika terjadi bencana atau musibah yang mengakibatkan rusaknya gedung atau alat, data tidak akan hilang. Terakhir, UMY sudah memfasilitasi pembayaran biaya kuliah atau PENMARU melalui sistem online (BMT Mobile), hal tersebut sangat membantu para mahasiswa dan orang tua dalam melakukan pembayaran perkuliahan yang lebih mudah dan cepat.