Ke:
Universitas Muhammadiyah Yogyakarta-Pimpinan

Pimpinan

REKTOR : Prof. Dr. Bambang Cipto, M.A
WAKIL REKTOR I : Dr. Ir. Gunawan Budiyanto, MP
WAKIL REKTOR II : Dr. Suryo Pratolo, M.Si.,Akt
WAKIL REKTOR III : Sri Atmaja P. Rosyidi, ST., MSc.Eng, Ph.D., PE.
Sekretaris Universitas : Ir. Nafi Ananda Utama, M.S
Badan Pelaksana Harian  
Ketua : Drs. H. A. Rosyad Sholeh
Wakil Ketua : Ir. H. M. Dasron Hamid, M.Sc.
Sekretaris : Drs. H. M. Sukiman, M.A.
Bendahara : H.M. Rossil Bakir, M. BA
Anggota : Dr. H. Agung Danarto, M. Ag.
Anggota : Prof. Dr. H. Syamsul Anwar, M.A
Anggota : Drs. H. Saebani, M. Pd
Anggota : Ir. Ahmad Syauqi S, M.M.
Senat  
Ketua Senat Universitas : Prof.dr.H.Moh. Anwar, M.Med., Sc., Sp.OG(K)
Sekretaris Senat Universitas : Ahdiana Yuni Lestari, S.H., M.Hum
Penjaminan Mutu Universitas  
Kepala Badan Penjaminan Mutu : Dra. Mutia Hariati Hussin, M.Si
Kepala Biro  
Kepala Biro Akademik : Drs. Bambang Rahmanto,
Kepala biro Sumber Daya Manusia : Drs. Gita Danupranata, MM
Kepala Biro Keuangan : Dra. Arum Indrasari, Akt, M.Buss
Kepala Biro Pengelolaan Aset : Surya Budi Lesmana, ST, MT
Kepala Biro Umum : Solahuddin Fatkhur, S.Ag
Kepala Biro Kemahasiswaan, Alumni dan Pengembangan Karir : Haris Aulawy, SH, MHum
Kepala Biro Penerimaan Mahasiswa Baru : Dr. Siti Dyah Handayani, MM
Kepala Biro Humas dan Protokol : Tunjung Sulaksono, SIP, M.Si
Kepala Biro Hukum : Wiratmanto SH, M.Hum
Kepala Biro Kerjasama : Dr. Ir. Indira Prabasari, MP
Kepala Biro Sistem Informasi : Wahyudi, ST, MT
Lembaga  
Kepala Sekretariat Universitas : Dedik Haryono, SH
Kepala Lembaga Pengembangan Penelitian, Pendidikan dan Masyarakat : Dr. Mukti Fajar Nur Dewanta, S.H., M.Hum.
Kepala Lembaga Pengkajian dan Pengamalan Islam : Syakir Jamaluddin, S.Ag, M.Ag
Kepala UPT Perpustakaan : Drs Lassa HS
Kepala UPT Pusat Pelatihan Bahasa : Noor Qomariya Agustina, S.Pd. M. Hum
Kepala Unires : Ghoffar Ismail, S.Ag, MAg.
Pascasarjana  
Direktur Program Pascasarjana : Dr. Ir. Gunawan Budiyanto, MP
Ketua Program Doktor (Psikologi Pendidikan Islam) : Dr. H. Muhammad Anis, MA
Ketua Program Doktor (Politik islam) : Prof. Dr. Bambang Cipto, M.A
Ketua Program Magister Manajemen : Prof. Dr. Heru Kurnianto Tjahjono, M.M.
Ketua Program Magister Studi Islam : Dr.Arif Budi Raharjo,M.Si
Ketua Program Magister Ilmu Pemerintahan : Dr. Ulung Pribadi
Ketua Program Magister Keperawatan : Sri Sumaryani, M.Kep Sp. Mat
Ketua Program Magister Manajemen Rumah Sakit : dr. Erwin Santosa, Sp. A., M.Kes.
Dekan Fakultas  
Dekan Fakultas Agama Islam : Dr. Nawari Ismail, M.Ag
Dekan Fakultas Ekonomi : Dr. Nano Prawoto, M.Si
Dekan Fakultas Hukum : H. M. Endrio Susilo, SH, M.Cl
Dekan Fakultas ISIPOL : Dr. Ahmad Nurmandi, M.Sc.
Dekan Fakultas Kedokteran : dr. Ardi Pramono, SP.An.,M.Kes
Dekan Fakultas Pertanian : Ir. Sarjiyah, MS
Dekan Fakultas Teknik : Drs. Sudarisman, M.Sc, Ph.D
Dekan Fakultas Pendidikan Bahasa : Jati Suryanto,S.Pd.,M.A.
Direktur Program Vokasi : Ir.Sudarja,M.T